More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0362 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 177 aa  360  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  79.52 
 
 		 173 aa  281  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  64.02 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  62.11 
 
 		 168 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  61.31 
 
 		 174 aa  201  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  58.02 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  60.25 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  54.37 
 
 		 167 aa  184  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  55 
 
 		 170 aa  177  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  53.12 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  49.72 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 168 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 207 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  47.02 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  47.53 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  46.01 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  47.8 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  52.48 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  35.45 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  34.55 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  29.11 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1179  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1206  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.0194653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  33.68 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  29.37 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>