More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6435 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 178 aa  350  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  55.48 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  44.64 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  48.97 
 
 		 166 aa  128  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  45.58 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  40.43 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  41.23 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  36 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.17 
 
 		 312 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  33.08 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  40.51 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  34.84 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 151 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  32.95 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  29.32 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  22.64 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 137 aa  51.2  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  33.96 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 138 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 208 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 310 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  28.49 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>