More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0387 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 168 aa  329  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  58.94 
 
 		 189 aa  177  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  59.73 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  45.58 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  38.56 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  36.3 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  38.33 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0782  putative helix-turn-helix transcriptional regulator  27.84 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  31.71 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  31.71 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  29 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  28.89 
 
 		 283 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  35.63 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 313 aa  47.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>