More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2414 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 176 aa  336  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  82.39 
 
 		 176 aa  268  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  37.67 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  25.58 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  39.56 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  35.81 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  32.17 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  33.11 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  41.57 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  34.19 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  28.48 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  38.94 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  33.64 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 172 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>