More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02870 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  300  5.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 		 138 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  47.33 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  43.16 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  33.91 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  34.62 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  30.5 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  36.36 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0188  transcriptional regulator, MarR family  46.73 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  33.06 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>