More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2565 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 176 aa  338  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  82.39 
 
 		 176 aa  268  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  40.41 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.92 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  35.9 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  41.11 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  37.17 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  40.71 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  35.11 
 
 		 137 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  38.36 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  43.06 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.73 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 296 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  42.17 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  31.58 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>