165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4115 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 165 aa  315  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  47.66 
 
 		 141 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 138 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  30.22 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  24.65 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  24 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  22.76 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 296 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  29.3 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  26.13 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  29 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  25.56 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0090  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 138 aa  44.3  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  32.53 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  35.9 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  32.53 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 303 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  23.47 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.68 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1243  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0356088  normal  0.548993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.56 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31.9 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  30.68 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 174 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>