242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2500 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  265  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2720  MarR family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  34.57 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 180 aa  48.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  33.91 
 
 		 292 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  29.55 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  29.55 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  34.51 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  32.73 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.1 
 
 		 283 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  34.44 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  36.59 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 312 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  36.47 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 208 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  39.53 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>