287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1308 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 189 aa  367  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  61.16 
 
 		 190 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 258 aa  72  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  38.78 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35.07 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  36.81 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  36.79 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  25.38 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  33.98 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 140 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 173 aa  51.2  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.77 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  28.32 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  28.32 
 
 		 136 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 136 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 146 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 154 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 142 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.63 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  32.17 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.63 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  33.65 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>