105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3261 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  310  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  82.89 
 
 		 153 aa  227  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 159 aa  84  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 258 aa  64.3  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.72 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 182 aa  51.2  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.71 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0775  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  39.06 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  31.51 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  28.7 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 143 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 143 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 142 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 161 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 143 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  35.11 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.13 
 
 		 325 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  32.39 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>