More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0672 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  300  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 162 aa  187  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  58.87 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  54.07 
 
 		 189 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  54.24 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  40.43 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 165 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35.81 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  36.09 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  45.68 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.5 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  58.33 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.08 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.08 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.16 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  33.64 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 181 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>