102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6961 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  305  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 258 aa  70.5  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  37.41 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.23 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  37.65 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  29.31 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 292 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.54 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.54 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.63 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0775  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  34.29 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02510  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 309 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0329478  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  35.42 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  19.72 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  31.31 
 
 		 153 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 156 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  25.96 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 143 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  25.85 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 296 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  27.37 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>