266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2790 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  335  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  31.39 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  43.28 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  34.29 
 
 		 132 aa  51.2  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 168 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  34 
 
 		 140 aa  51.2  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  34.78 
 
 		 283 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 168 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  33.99 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  26.61 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  48.08 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  43.08 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  37.18 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  29.7 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35.58 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  24.11 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 202 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  29.29 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 141 aa  44.7  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  46.3 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>