100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0910 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  348  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  95.45 
 
 
176 aa  337  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  95.57 
 
 
158 aa  298  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  59.33 
 
 
157 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
158 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  36.73 
 
 
165 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  31.62 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  30.63 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  29.9 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  38.1 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 
157 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2174  regulatory protein, MarR  38.38 
 
 
133 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 
198 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
165 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
152 aa  51.6  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
141 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
150 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
173 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
165 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
150 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  20.34 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 
160 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  26.58 
 
 
283 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
315 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  32.47 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
223 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  39.34 
 
 
166 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  31.65 
 
 
132 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
309 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
310 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  31.25 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  22.34 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  29.29 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 
161 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
307 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  41.07 
 
 
160 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 
154 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
153 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 
177 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
143 aa  41.6  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
340 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.54 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  26.92 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
340 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
326 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
178 aa  41.2  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
165 aa  41.2  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 
149 aa  41.2  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
143 aa  41.2  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  24.84 
 
 
184 aa  40.8  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
156 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
157 aa  40.8  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
195 aa  40.8  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
147 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>