284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2171 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 132 aa  261  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 172 aa  76.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  34.62 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.43 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  32.04 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 201 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 165 aa  50.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  33.75 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  36.08 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 170 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>