More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0649 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
152 aa  293  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  33.82 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  34.82 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
192 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
172 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  33.33 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  32.41 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
175 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.04 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
187 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 
166 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  30.77 
 
 
292 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  25.18 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0886  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.221298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  32.91 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  23.45 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
176 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  27.45 
 
 
195 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  40.32 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  30.47 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  40.32 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  40.32 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  29.46 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.71 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  29.63 
 
 
203 aa  47.4  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
169 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
150 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
173 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
139 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
140 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>