71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0540 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  336  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 		 157 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  35.8 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  37.36 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  37.21 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.73 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 325 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.45 
 
 		 326 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 323 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 326 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 326 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 164 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  42  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 153 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 326 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 165 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 321 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 223 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>