More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4796 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  299  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  35.25 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 201 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  34.91 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  31.13 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  43.82 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  44.74 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.42 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  40.17 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  32.97 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  40.45 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  36.26 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  47.27 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  26.02 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  36.04 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>