214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2759 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 140 aa  268  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  44.05 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 174 aa  50.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  43.28 
 
 		 163 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  34.78 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 301 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  32.29 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  36.08 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  31.68 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  42.86 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  41.57 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  27.5 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 141 aa  43.9  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 149 aa  43.5  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  35.16 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  41.79 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>