More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1949 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  99.33 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  99.33 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  97.32 
 
 		 149 aa  294  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  95.3 
 
 		 149 aa  288  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  93.29 
 
 		 149 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  93.29 
 
 		 149 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 149 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 149 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 149 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 149 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 149 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 149 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 173 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 151 aa  207  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  62.42 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  64.54 
 
 		 149 aa  199  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 168 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  31.43 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  31.36 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  28.78 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  29.93 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  27.33 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.05 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  32.43 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  32.26 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  27.97 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  29.57 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.96 
 
 		 304 aa  50.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2666  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.95 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.56 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>