219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0762 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 178 aa  347  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  49.14 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  53.12 
 
 		 160 aa  85.1  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  39.83 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  33.55 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 146 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  47.44 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  49.35 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  37.37 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 143 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  32 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  26.63 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  23.77 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  53.7 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  47.89 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 292 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 139 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>