90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9192 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  53.64 
 
 
165 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
163 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  35.61 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
176 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  40 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  40.45 
 
 
173 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
178 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
164 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  50.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
329 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  34.26 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  31.25 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.33 
 
 
316 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
157 aa  47.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  47.54 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
152 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  30.51 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  46.3 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.52 
 
 
325 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
327 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
202 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  30.7 
 
 
132 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  25.19 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
310 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  22.99 
 
 
313 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
166 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  19.2 
 
 
283 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
161 aa  44.3  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  31.71 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 
188 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
321 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
322 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
141 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
172 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
145 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  46.67 
 
 
153 aa  41.2  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  28.43 
 
 
150 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>