More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2828 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
142 aa  288  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  92.96 
 
 
142 aa  268  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  92.96 
 
 
142 aa  268  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  92.96 
 
 
142 aa  268  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  92.96 
 
 
142 aa  268  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  92.96 
 
 
142 aa  267  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  92.96 
 
 
142 aa  267  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  92.25 
 
 
142 aa  265  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  91.55 
 
 
142 aa  264  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  92.25 
 
 
142 aa  263  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  29.77 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
157 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
167 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  32.06 
 
 
206 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
139 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 
175 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
183 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  27.97 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 
198 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.11 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.91 
 
 
174 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  38.33 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 
158 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  34.41 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 
296 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 
153 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
150 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  31.19 
 
 
174 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>