193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0501 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  69.54 
 
 		 170 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  69.18 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  47.02 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2134  regulatory protein, MarR  38.58 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2290  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  30.36 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  28.83 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 182 aa  51.2  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  23.88 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  34.29 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  26.61 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  27.34 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  32.03 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  26.56 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  32.94 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  33.75 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  27.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 152 aa  44.3  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  29.63 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>