More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0359 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  35.71 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  34.65 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.03 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.11 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 162 aa  50.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  29.37 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.36 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 183 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  29.52 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>