More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4610 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  300  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  43.85 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  39.39 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  31.4 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30.58 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40.19 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.53 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  21.77 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  33.57 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  31.43 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  35.71 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  30.15 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  30.77 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.59 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  41.76 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  28.77 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  27.87 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  34.9 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>