More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4897 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  37.61 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  37.93 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  38.94 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  35.59 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  42.73 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  30.84 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  43.84 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30.84 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  35.45 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 219 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  33.87 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  34.19 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.09 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.05 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  34.95 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  27.61 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  31.71 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  27.97 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  26.87 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  35.04 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  29.14 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  26.47 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.05 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  33.65 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>