More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4560 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  89.74 
 
 		 193 aa  305  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  77.19 
 
 		 219 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  81.29 
 
 		 213 aa  226  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  76.61 
 
 		 213 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  78.38 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 163 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40.15 
 
 		 153 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 146 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  38.19 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  31.71 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  30.23 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  23.89 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  29.1 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 157 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.36 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  34.82 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 145 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  28.68 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  34.38 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  29.7 
 
 		 139 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 171 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 138 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 172 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 155 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.7 
 
 		 139 aa  51.2  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  34 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 161 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 138 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  36.08 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  26.35 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  39.33 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>