More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2897 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  289  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  30.48 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  33.61 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  33.61 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  45.57 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  23.14 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  31.91 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.8 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  28.93 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  26.23 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  29.66 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  33.63 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 172 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.28 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  24.66 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>