More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1723 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
171 aa  342  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  80.7 
 
 
171 aa  278  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  78.49 
 
 
172 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  70.51 
 
 
163 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  70.51 
 
 
163 aa  227  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  70.51 
 
 
163 aa  227  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  70.51 
 
 
164 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  69.87 
 
 
164 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  69.23 
 
 
163 aa  220  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  66.46 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  66.46 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  66.46 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  66.46 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  66.46 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  66.46 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  66.46 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  65.84 
 
 
165 aa  215  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  72.22 
 
 
164 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  43.38 
 
 
149 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  43.48 
 
 
147 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 
178 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
158 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 
171 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
171 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
195 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  41.45 
 
 
178 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
157 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
178 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  35.81 
 
 
180 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  36.3 
 
 
177 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
165 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
165 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
165 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
165 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
165 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
163 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
163 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
145 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  36.29 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  36.55 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  36.55 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
162 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
162 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 
177 aa  84.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  35.29 
 
 
159 aa  84.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
160 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
182 aa  84  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  32.62 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.79 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
145 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  45.36 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
139 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
139 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.07 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  33.57 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>