296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0863 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 208 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  70.2 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  75.86 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  76.47 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  73.65 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  72.84 
 
 		 195 aa  201  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 163 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 166 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  38.69 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  38.4 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  31.78 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.47 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 151 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 139 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 139 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  42.27 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 138 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 162 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 138 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 138 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 138 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 138 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 167 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 138 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  42.05 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  44.29 
 
 		 149 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 167 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 143 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 143 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 143 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 141 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 167 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 147 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 167 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  18.66 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  35.29 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 141 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.77 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 157 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 150 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 163 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.52 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  32.99 
 
 		 283 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  32.37 
 
 		 163 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  37.65 
 
 		 137 aa  48.5  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 163 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  37.63 
 
 		 156 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>