More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2247 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  278  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  40 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  38.1 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  42.35 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  35.25 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 166 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 179 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  34.58 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.02 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  40 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  31.73 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>