206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0987 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  82.24 
 
 		 156 aa  266  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  80.79 
 
 		 159 aa  254  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1376  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1365  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1400  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1264  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1525  transcriptional regulator, putative  32.18 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  28.57 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 173 aa  50.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 138 aa  50.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  23.68 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  34.25 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  27.21 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1325  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1389  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000012285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 277 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  23.26 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  25.18 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  28.74 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  22.83 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  30.56 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 142 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>