More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003355 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  31.2 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  32.65 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.46 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  28.17 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  28 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.62 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.62 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.62 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.62 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.62 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.62 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.69 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.69 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  36.76 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  37.14 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  24.53 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  24.67 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>