273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0436 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  204  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  71.84 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 160 aa  76.6  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  34.74 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  34.74 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  34.74 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  34.74 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  34.74 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  34.74 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  34.74 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  34.74 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  32.29 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  34.34 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  32.29 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  31.58 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  31.58 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  31.58 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  31.58 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 411 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  31.58 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  31.94 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.22 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.22 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.22 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.22 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.22 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>