281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0669 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  33.1 
 
 		 151 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  33.07 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 141 aa  62  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  39.64 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.98 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  33.98 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  32.99 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  32.99 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32.99 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32.99 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.99 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.1 
 
 		 149 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  35.16 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 143 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 154 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 149 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 157 aa  51.6  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 161 aa  51.2  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 150 aa  51.2  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 		 144 aa  51.2  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  22 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.78 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  30.97 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  26.92 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  29.85 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  27.39 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  31.46 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  29.31 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 155 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 157 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 154 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 138 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 146 aa  48.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>