More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1741 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  292  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  74.17 
 
 		 152 aa  221  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  73.15 
 
 		 152 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  32.37 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.53 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  27.54 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  33.6 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31.9 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  31.9 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  28.78 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  32.59 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  31.06 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  31.06 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  31.06 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.48 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  20.93 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 168 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>