More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1245 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  32.41 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.64 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  33.83 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  33.64 
 
 		 139 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  30 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 140 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  28.57 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  28.3 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  26.72 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  23.66 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  23.68 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 155 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 141 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  26.04 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>