More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4422 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  99.28 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  71.11 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  37.78 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 201 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 198 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  31.97 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.61 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.01 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 192 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 192 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.08 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  30.56 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.7 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.7 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  57  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  30.28 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  41.54 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.6 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>