204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2923 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 174 aa  224  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  59.46 
 
 		 192 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  59.46 
 
 		 192 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4788  MarR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.421103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  30.63 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  32.17 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  31.9 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  34.23 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  32.21 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  26.02 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  26.24 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  32.86 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 150 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  23.14 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  23.14 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  24.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  24.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  29.75 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 144 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 		 139 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 147 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 152 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>