299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4809 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  85.57 
 
 
192 aa  345  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  85.57 
 
 
192 aa  345  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  59.39 
 
 
193 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  57.86 
 
 
181 aa  194  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  53.05 
 
 
174 aa  192  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  56.76 
 
 
176 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4788  MarR family transcriptional regulator  79.79 
 
 
124 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.421103  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
168 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
146 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.73 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  35.09 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  28.78 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
138 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.06 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 
151 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
138 aa  61.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
138 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
147 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 
149 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
141 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  28.21 
 
 
138 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.33 
 
 
155 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
168 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
143 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  36.27 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 
155 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  30.77 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
140 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.71 
 
 
162 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
161 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
143 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
143 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
138 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 
138 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
138 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
138 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
157 aa  55.5  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  24.24 
 
 
139 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
137 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
159 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
143 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
199 aa  54.7  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
154 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
149 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 
139 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  22.82 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
139 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 
139 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
159 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
139 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
153 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 
139 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
139 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
145 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 
151 aa  52  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
158 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
137 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  29.52 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
150 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
175 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
141 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
147 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  26.12 
 
 
148 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
138 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
161 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 
150 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 
148 aa  48.9  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
147 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
163 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  28.91 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>