More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2856 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 167 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 153 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.84 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  31.82 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.09 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 303 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  32.58 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  32.58 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  32.58 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  32.58 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  32.58 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  28.68 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  29.29 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  35.05 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>