295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3140 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
205 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
201 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
195 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.56 
 
 
177 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
142 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
142 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
303 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
141 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
153 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
188 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
135 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.47 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  32.56 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  31.13 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 
187 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0020  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 
234 aa  47.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.965636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
315 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>