More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4219 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  350  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  57.35 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  52.59 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  57.03 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 158 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 158 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 152 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.12 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  42 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  29.48 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  38 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  31.73 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  29.78 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 315 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>