More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2313 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 158 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  63.09 
 
 		 158 aa  193  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 152 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 148 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 148 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 148 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  60.14 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 180 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  36.22 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  28.35 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.23 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  28.35 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  28.35 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  28.35 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  28.35 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.3 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.3 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.3 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.3 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.3 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  29.41 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0100  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2146  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  0.322548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  30.97 
 
 		 214 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>