More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3234 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
151 aa  304  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  99.34 
 
 
150 aa  298  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  76.55 
 
 
159 aa  228  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  57.34 
 
 
169 aa  163  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
190 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
161 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
178 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
153 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  39.58 
 
 
177 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
175 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  41.29 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 
176 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
176 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  42.15 
 
 
170 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
172 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
158 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
315 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
174 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
188 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
150 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  36.88 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
162 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
162 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
172 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
162 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
185 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
179 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
195 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
184 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
172 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
172 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
180 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
201 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  38.96 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  28.89 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
303 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.06 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  31.36 
 
 
169 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.06 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.06 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.06 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.06 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  30.28 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.06 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.06 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>