More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3191 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  48.03 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  46.51 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  51.28 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  51.28 
 
 		 154 aa  121  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  40.29 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  40.74 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.74 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.74 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  43.94 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  43.94 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  43.94 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  43.94 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  43.94 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  43.94 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  42.22 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  42.22 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  43.18 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.13 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.13 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.13 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.13 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.13 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  44.54 
 
 		 157 aa  105  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  37.23 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  40.91 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 184 aa  98.2  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 174 aa  90.1  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 145 aa  84.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  40.23 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  29.71 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  29.32 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  26.12 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  28.3 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  28.18 
 
 		 165 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>