More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2463 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  50.41 
 
 
163 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  50.41 
 
 
157 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  51.15 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  47.76 
 
 
164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  40.71 
 
 
140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  46.32 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 
145 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
184 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
166 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
144 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 
154 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  42.11 
 
 
145 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 
140 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  41.04 
 
 
145 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  41.04 
 
 
145 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.04 
 
 
145 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  41.04 
 
 
145 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
161 aa  99.4  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  40.29 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 
154 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.3 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.3 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
161 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 
152 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0771683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  41.48 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  41.48 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.48 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.48 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  44.19 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
140 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  44.19 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
148 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
140 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  37.78 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.44 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.44 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.44 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.44 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.44 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  34.17 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  33.67 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
171 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
151 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
201 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  28.78 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 
170 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  38.67 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  35.78 
 
 
190 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  31.52 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  35.78 
 
 
190 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
174 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
154 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.04 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25 
 
 
316 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  30.16 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  33 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1124  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>