More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A1067 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  311  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  100 
 
 
157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  67.39 
 
 
167 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
171 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
178 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 
154 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  44.85 
 
 
164 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
144 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  43.28 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 
145 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  40.3 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  40.3 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.3 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.3 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  40.77 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
140 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  40.31 
 
 
154 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
161 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
146 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
146 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 
154 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 
140 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.03 
 
 
145 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
155 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.03 
 
 
145 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.03 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  36.03 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  36.03 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.03 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  36.03 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  36.57 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.57 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.84 
 
 
146 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.84 
 
 
146 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.84 
 
 
146 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.84 
 
 
146 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.84 
 
 
146 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  36.51 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
150 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
152 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  27.7 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  28.12 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  27.86 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  32.22 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  32.28 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
185 aa  57.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.77 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  31.91 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  31.31 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>