More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6873 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  322  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  76.55 
 
 
151 aa  228  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  77.86 
 
 
150 aa  227  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
169 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  47.18 
 
 
190 aa  120  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
161 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
153 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
175 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  37.23 
 
 
177 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
161 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
176 aa  97.1  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  36.55 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
170 aa  94.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
174 aa  94  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
172 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
150 aa  90.5  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
189 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
315 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
179 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
142 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
193 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 
180 aa  58.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
139 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
303 aa  57.4  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 
155 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.78 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.78 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.78 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.78 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.78 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
201 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.78 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>